DNA analysis in animals using molecular genetic techniques
DNA ���������� �з�
���� ���ܳ��� Ư�� ������ �븳�����ڰ� 2���� �̻� �����ϰ� ��� Ư�� �븳�������� �󵵰� �ּ��� 1% �̻��� ������ ������ �� ������ ��������(genetic polymorphism)���� �����Ѵ�. ������ ������ �������� ���� ������ 1980��� �Ĺݱ��� �ַ� ������ �깰�μ� �ܹ��� �� ȿ�� ���ؿ��� ���� ������ ������ ����ü(genetic variant)�μ� ������ �׿����� ������, ���� �� ���� �ܹ������� ��ȭ���� ����(biochemical polymorphism) �׸��� �ֿ����� ���ռ� ����ü(major histocompatibility complex; MHC) �׿��� ���� �߽����� �̷���� �Դ�. �׸��� �̵� �鿪���� �� ��ȭ���� ������ ������ ǥ���� ������ ��ü�ĺ� �� ģ�ڰ����� ���� ������ ����� �Ĵ���� ���, ������ ������ �����м�, ǰ���� ������ �ٿ����� �� ������������ ������� �м� � �� �а� �̿�Ǿ��� �Դ�. ��������� ������(������ �׿��� �� ��ȭ���� ����)�˻�� 1950������ �������� �񱳽����� ���Ͽ� ���������� ���ε� ��üȮ�� �� ģ���Ǻ��� ���� �ǹ�����μ� ��, ��, ���� �� ���� ���������� ��������� ���������� Ȱ��ǰ� �ִ�. �׷��� �ֱٿ��� ���������� �� DNA �м� ����� ���ν� �ߴ޿� ���Ծ� �ܹ����� ȿ���� ������ �깰�κ��� ������ �� ��ü ��, DNA ���ڼ��ؿ��� ������ ���������� ���� �� �� �̿��� Ȱ���� �����ǰ� �ִ�. DNA�� ��ȣ ����(coding regions)�� ������ ����� �����ϴ� �ܹ��� �ռ��� ���� ���������� ����� ����(non-coding regions)�� �������� ����� �˷��� ���� �ʴ�. �׷��� ����ü���� �� ������ ����� ������ ������ ���̰� �����ϰ� �־� ��ü���� ������ ���̸� �����ϴµ� �߿��� ������ �Ѵ�. ���������� �Գ𿡴� ����� ������ ������ �������� �����ϰ� �־� ���� ����(structural loci)�� �� 5-10%�� ���⿵��(electrophoresis) ����� ����Ǵ� ���������� ���̰� �ִ� ������ �����ϰ� �ִ�. �ٳ� ������ �Գ��ؼ� ����� �޼��� ������ �̷��ϹǷν� Ư�� ������ �����ϴ� ������ �Ǵ� �����ڷμ� ����� ������ ��ü���� ���̼��� ��Ÿ���� DNA ǥ�����ڰ� �ټ� ���ߵǾ��� �ְ� ���ư� �̸� �̿��Ͽ� ������ ����(gene map)�� �ۼ��Ǵ� �ܰ迡 �ִ�. DNA ���������� �� ���� ���Ⱑ ġȯ�Ǿ� �߻��ϴ� ����(���������� ; point mutation)�� ª�� DNA ����迭�� �ݺ�ȸ���� ���̷� �Ͼ�� ����(�ݺ��迭 �� ����)���� ũ�� �����Ҽ� �ִ�. �̵� DNA ������ �м� ��������� ��� ������(Southern blotting)�� ���� �ٻ� ȥ��ȭ(hybridization)���� �ٻ�����ȿ�� �������(polymerase chain reaction, PCR)�� �� ������ ���ڻ������� ����� �̿��Ͽ� �����ϰ� ���� �ؼ��� ������ �����ڸ� DNA ǥ�����ڷ� Ȱ���ϰ� �ִ�. Ư��, �ֱٿ� in vitro������ �ҷ��� DNA�κ��� �������� �ϴ� ������ �����ڸ� Ư�������� �뷮 ������ų �� �ִ� PCR ����� ������ DNA ���ؿ��� �������� �м��� ȹ������ �ߴ��� �������� �Ͽ���. �� ����� �������� ����м� ����� ���Ͽ� �ؼҷ��� �÷�� DNA �м��� �����ϹǷ� �ΰ��� �� �м��� �żӼ��� ������ ���� �ſ� ū ���� ������ ���� �������� �ٰ����� �ϴ� ���������� ���ʺоߴ� �����̰� ������� ����о߿��� �� Ȱ������� �޼��� Ȯ��Ǿ� ���� �ִ�. Ư��, ���Ĺ��� DNA �����м��� �߿��� �ٽɱ���μ� �� ���䰡 ���������� �����ϰ� �ִ�. DNA�� ���� ���ؿ��� ���������� ������ �� �� ������ Ư���� ���� ����ȿ�� ���� �����(restriction fragment length polymorphism; RFLP), ������ ����(DNA fingerprinting; DFP), ���� ���� DNA ����(random amplified polymorphic DNA; RAPD), ���ϰ��� ��������(single strand conformation polymorphism; SSCP), ������ü ����(microsatellite polymorphism), �������� �����(amplified fragment length polymorphism; AFLP) ������ �з��� �� �ִ�.










DNA polymorphism �м�
1) ����ȿ�� ���� �����(RFLP)

RFLP�� DNA ����迭 ���ؿ��� ���̼��� �����ϱ� ���� ���� ���� ���ߵ� DNA ���������� �̴� ��� Ư���� ������ ����(gene locus)�� DNA ������ ����迭�� ����̳� ���� �Ǵ� ġȯ �� ���̷� ����ȿ�� ó���� ���� ������ DNA ���� ���̰� ��ü���� ���̰� ���� ��� �������� ��Ÿ����. RFLP�� Ư���� ����迭�� �ν��ϴ� ����ȿ�ҷ� DNA�� ������ �� ����ȿ�� ���������� ���� ���ο� ���� ũ�Ⱑ �ٸ� �پ��� DNA ������ Ư�� �������� cDNA(complementary DNA)�� DNA ������ ���κ�(probe)�� �̿��� Southern blot���� ���� �����Ѵ�. �ֱٿ��� PCR���� �̿��ϹǷν� ������ ����� ���� ���� �ż��ϰ� �����ϰ� RFLP�� ������ �� �ִ�. ��, �������� �ϴ� DNA ������ ���⼭���� �̹� �˷��� �ִٸ� �� ������ �����ϰ� �ִ� DNA ������ Ư������ �����̸�(primer)�� �̿��� PCR������ �����ϰ� Ư���� ����迭�� �����ϴ� ���� ����ȿ�ҷ� �����깰�� ������ �� ���⿵������ �پ��� ũ���� DNA ������ �и� �����Ѵ�. ������� ��, ��, ����, �� �� ���� ����ǰ������ ������ ����� �� �˷��� �ִ� ����ȣ����, ���Ѷ�ƾ(prolactin), ���� �ܹ���, �۷κ�(globin) �� MHC ������ �� �ټ��� ������ �������� RFLP�� �����Ǿ��� ������ ���������� �߿��� ������������ ������ �м� �� ������ �����ۼ��� ������ DNA ǥ�����ڷ� �̿�ǰ� �ִ�.

2) DNA ����(DFP)

���� �Գ��� ���� �������� ����迭�� ���̰� 50-200bp�� ª�� �̼�����ü(minisatellite) DNA�� ���� �ݺ��迭(tandem repeat)�� �� ����ü�� �پ��� �ݺ����� ���� �����ϰ� �ִ� ����������(hypervariable loci)�� �����Ѵٴ� ����� �˷��� �ִµ� DNA probe�� ����ȿ�ҿ� ���� Ư�� ����ü���� �������¿� �����ϴ� �ݺ� �迭���� ���̿� ���� ���̼��� �����ϴ� ���������� Ư�̼� ������(single locus specific polymorphism)�� �ݺ��迭�� ����(variable numbers of tandem repeat ; VNTR) �̶�� �Ѵ�. Ư�� �Գ�� ����Ǿ� �ִ� �ݺ��迭�� ������ �ټ��� VNTR ������ ���ÿ� �����ϴ� �������� Ư�̼� ������(multilocus specific polymorphism)���μ� RFLP �Ǵ� VNTR���� �ٸ� �ټ��� ������ ���(band) ��, bar code ���� �ٹ��� ������� �ΰ��� ������ ������ ��ü Ư���� ������ band ����� ���̴� DNA �������� ������ �����̶�� �θ���. ���࿡�� ��κ��� RFLP�� ���� �ΰ��� �븳������ ����(diallelic system)�� �����Ͽ� �������ռ�(heterozygosity) �� �������� �ſ� ���� ����м��̳� ��������� �� �̿��� �������̳� ������ ������ ��ü Ư�̼��� ��� ���� �Բ� �ټ��� DNA ������ ���ÿ� �����ϴ� ����μ� �������� ���������� ��Ÿ����. DNA ���� �м����� �� ��ü Ư���� �������� �̿��Ͽ� �ΰ��� ��� ������ �� ���ڰ��� �� �׸��� �߻������� �־�� ����м�, �ൿ�� � ����ǰ� ���࿡ �־�� ������ ������ ��ü�ĺ� �� ģ�ڰ����� �ſ� ������ �������� �̿�� �� �� �ƴ϶� ���� ���������� ���õ� DNA ǥ�������� �ĺ��� �߿��� ��ǥ�� �� �� �ִ�.

3) ���� ���� DNA ����(RAPD)

RAPD ����� ������ �����̸�(random primer)�� ����Ͽ� �Գ� DNA ���⼭�� ������ ���Ƿ� �������� DNA ǥ�����ڸ� ã�� DNA �����м� ������� AP(arbitrarily primed)-PCR ���̶���� �θ���. RAPD �м������ ǥ�� �������� Ư�� ���⼭���� ���� �������� ���̵� ������ ª��(10-bp) ���⼭���� ���� �ø�����Ŭ����Ƽ��(oligonucleotide) �����̸Ӹ� �̿��Ͽ� genomic DNA���� ���� ������ �����Ͽ� �������� �����ϹǷ� �������� �����̸��� ���۰� �̿��� �����Ͽ� ������ ������ ���⿡ ȿ�������� Ȱ���� �� �ִ�. RAPD �м��� PCR ����� ���� �̷�����Ƿ� Ư�� �̷��� DNA �÷ᰡ �䱸�Ǹ� �м������� �ż��ϰ� �������� ���� �ܼ��ϸ� ��缱 �������ҵ� �ʿ�ġ �ʾ� ��Ը� �÷�м��� �����ϴ�. ���� RAPD ǥ�����ڴ� ������ �����ۼ��� �̿� �����ϰ� ���� ǰ�������� ������ ���̼�, ������ Ư������, ǰ���ĺ� �� �������� �� �����ڿ��� �����м��� ���а� ����ǰ� �ִ�. �׷��� RAPD ǥ�������� ��������� �켺(dominant)�̱� ������ ���������� ���ݸ��� �����ϴ� ������ �ְ� �������ǿ� ����� �ΰ��ϰ� �����Ͽ� �������� ���ٴ� �������� �����ǰ� �ִ�.

4) ������ü ����(Microsatellite)

���������� �Գ��� �� 20-30% ������ ��κ� (GT/CA)n�� �ݺ��迭�� �̷�� DNA ���⼭���� �����Ǿ��� �ְ� ������ ��� �ҿ����� 6-10%�� �ݺ� ����迭�� �����Ǿ��� �ִٰ� �Ѵ�. �ֱٿ� ������ Ȱ���� �����ǰ� �ִ� PCR����� DNA ���� ���������μ� microsatellite(MS)�� SSR(simple sequence repeates) �Ǵ� STR(short tandom repeats)�̶���� �Ѵ�. MS�� genomic DNA �߿� �����ϰ� �ִ� ª�� (1-6bp) �ܼ� ���� �迭�� �ݺ��ϰ� �ִ� ������ �ݺ��������� ���̿� ���� DNA ���������μ� Ư�� �Գ� ������ ���� ���� �����Ǿ� �ְ� MS ������ ���� ������ �븳������ ���� �������� �ſ� dz���Ͽ� ������ �������� ��Ÿ���� ���켺�� ��������� ���´�. ��ó�� �ݺ� ����迭�� �ݺ����� dz���� �پ缺���� ��ü���̳� ǰ�����ܳ����� ������ ���̸� �����ϴµ� �ſ� �̻����� DNA ǥ�����ڷ� �˷����ִ�. MS ǥ�����ڴ� �������� �������谡 ����� ���質 ���밣���� ���� ������ �������ռ��� ���̹Ƿ� ���賻 �����м��� �ſ� ȿ�������� �̿��� �� �־� ������ ������ �������� �ۼ��� ����� ������ ������ �˷��� �ִ�. MS�� 3-4������ ��������� ǥ���� primer�� �̿��Ͽ�
multiplex-PCR�� ������ �� �����깰�� Auto DNA sequencer�� �����Ͽ� ���� data�� �ڵ����� �ؼ��� �� �ִ� ������ �ִ�. ��ó�� MS ǥ�����ڴ� ������ dz���� �������� �Բ� DNA�� �ڵ��м��� �����ϰ� ������ �˻������ �־� ǥ������ ������ ȿ������ ��Ȯ���� ���� �ٸ� DNA ǥ�����ڿ� ���Ͽ� ����� �ǿ�ȭ �� �̿밡ġ�� ��������� ����� ������ �򰡵ǰ� �ִ�. �ֱٿ� MS �������� ���� ������ ģ�ڰ��� �� ����м��� ���� ���ο� DNA ǥ�����ڷ� ������ �ް� �ִ�. MS�� Ư�� DNA probe ���� ���⼭�� ���������� �����ڳ� �������� ���������� �����ϸ�, �̿� �����Ͽ� ���� 1993����� ��������������ȸ(ISAG)�� �ְ��Ͽ� ������ �������� �񱳽���� �Բ� �� DNA ���� �м� ��� �����ϰ� MS ���� �˻翡 ���� �������� �񱳽����� �ǽ��Ͽ� ���� ǥ��ȭ�� ����ϰ� �ִ�. ���� �����δ� ������ ������ �˻�� �Բ� ģ�������� �żӼ�, ��Ȯ�� �� ���̼��� ���� MS�� ���������� ���ε� DNA�� �˻������� ����� ģ�ڰ����� ��ü�ĺ��� �̿�� ������ ���ǰ� �ִ�. ���ÿ� MS �������� ���࿡�� ���������������� ������ �м��� ���Ͽ� ���������̳� ���������� �����ִ�
DNAǥ������ ������ ���� �ĺ������� ������ �̿��� ũ�� �����ϰ� �ִ�.


5) ���ϰ��� ��������(SSCP)

RFLP�� ����ü ������ �����ϴ� �ΰ��� �븳�����ڸ� �����ϴµ� �ſ� ������ ��������� Ư�� ����ȿ�Ұ� ������ �� �ִ� ���⼭�� ������ ������ ���� DNA �������� ������ �� �ִ�. �׷��� DNA�� ������ ������ �̿��� �������� ������μ� �ֱٿ� ���ߵ� SSCP�� ������������ ���� ����ġȯ�� ���� ���⼭�� ��ȭ�� �߻��� DNA ���ϰ����� ���³� �������濡 ���� ���⿵������ �̵��ɷ� ���̿� ���ε� ������ �������� �м��ϴ� ������μ� 200bp ������ DNA ������ ���� 100% �׸��� 200-400bp ������ 80% ���� ���� ���⺯ȭ�� ���� ���̸� ������ �� �ִ� ���� Ȯ���� ���� �־� ������ RFLP ������� Ȯ�� �Ұ����� ���̱��� �����ϰ� �ż��ϰ� ������ �� �ִ� ������ DNA ������ ��������� �˷��� �ִ�. ���࿡�� ���������� ������ ���� ����ȣ����, prolactin, IGF-1(insuline-like growth factor-I receptor) ���� �ĺ������ڿ��� SSCP ǥ�����ڰ� ���ʷ� �������� �־� ���� PCR-SSCP ����� ������ ���ο� DNA �����м��� �Գ� �ؼ��� ����� ��밡 �Ǵ� ����̴�.

6) ���� ���� �����(AFLP)

AFLP�� ���� �ֱٿ� ���ߵ� DNA �����м� ����� �������� genomic DNA�� Ư�� ����ȿ�ҷ� ������ ���� ����ȿ�� ������ PCR�� ���� ���������� �����Ͽ� DNA �������� �м��ϴ� ����̴�. AFLP �м��� �⺻������ ������ 3 �ܰ迡 ���Ͽ� �̷������. ù°, genomic DNA�� ���ܺ����� ���� ���� �� ������ ����ȿ��(EcoR I�� Mse I)�� �̿��Ͽ� ���� �����ϰ� ��°, ���ܵ� DNA �������� �糡�� ����ȿ�� ���ܺ����� Ư������ �ø�����Ŭ����Ƽ�� adapter�� ������ ���� ��°, adapter�� ������ ����ȿ�� ���� ������ ���� ���⼭���� �����ϴ� primer(3��-���ܿ� 1-3bp�� ������ ���⼭���� ����)�� �̿��Ͽ� DNA ������ Ư�������� ������Ų �� DNA �����깰�� ���⿵�������� �и� �����Ѵ�. AFLP�� ���⼭���� ���� �������� ���� 1ȸ�� PCR �������� 50-100���� �ſ� ���� DNA ������ �����ϹǷ� DNA �����м��� ������ �������� �����ǰ� �ִ�. ���� �� ����� ������ RFLP�� RAPD ����� �Ȱ� �ִ� ���� �������� ���༺�� �غ��� �� �־� �������� �̹� Ư����� Ȯ���ϰ� ������ �Ĺ��� ��� genomic DNA�� AFLP �����м��� ���� kit�� ���ߵǾ� ��������� ���ǵǰ� �ִ�. ���ݱ����� �ַ� �Ĺ��̳� �̻����� DNA �����м��� �̿�ǰ� ������ ����� �巡�� ������ �Գ� �м��� ���� �а� ����Ǿ��� ������ ���ǰ� �ִ�.
DNA polymorphism�� �̿��� ���� ����
�������� ���� ������ȹ�� �־� ��ü���� �����ɷ� ���̴� ������ ȯ����ο� ���� ũ�� ����Ǵ� ǥ���� ����ġ���� �����Ͽ� �����Ǿ� �Դ�. �׷��� �ֱ� ������������ �ߴ��� ������ ������ ������ ���� ��Ȯ�ϰ� ������ ���ο� �������� ���� ���ɼ��� ������ �ְ� �ִ�. Ư�� DNA �������� ���� ������ DNA ���ڼ��ؿ��� ���� ��ü���� ������ ���̸� ���� Ȯ���� �� �ְ� �Ǿ���. DNA �������� ���ళ���� ���ʺκ��� ��ü�ĺ�, ģ�ڰ��� �� ����м� � �⺻������ ����� �� ������ ���������� �߿��� ������� ������ DNA ǥ�����ڷμ��� �̿��� �������� ���鿡�� ���� ������ ��ġ�� ���ϰ� �ȴ�. DNA ǥ�����ڸ� ������ ���������� �̿��� ��� ū ������ ��κ��� DNA ǥ�����ڰ� ���켺���� �ܼ��� �൨�� ��������� �����Ƿ� ��ü�� ���������� ���� ������ �� �ְ� ���� ��ü�� ���� ���ɿ� ���� ������ ���� �ʴ´�.
�������� ���� ������ȹ�� �־� ��ü���� �����ɷ� ���̴� ������ ȯ����ο� ���� ũ�� ����Ǵ� ǥ���� ����ġ���� �����Ͽ� �����Ǿ� �Դ�. �׷��� �ֱ� ������������ �ߴ��� ������ ������ ������ ���� ��Ȯ�ϰ� ������ ���ο� �������� ���� ���ɼ��� ������ �ְ� �ִ�. Ư�� DNA �������� ���� ������ DNA ���ڼ��ؿ��� ���� ��ü���� ������ ���̸� ���� Ȯ���� �� �ְ� �Ǿ���. DNA �������� ���ళ���� ���ʺκ��� ��ü�ĺ�, ģ�ڰ��� �� ����м� � �⺻������ ����� �� ������ ���������� �߿��� ������� ������ DNA ǥ�����ڷμ��� �̿��� �������� ���鿡�� ���� ������ ��ġ�� ���ϰ� �ȴ�. DNA ǥ�����ڸ� ������ ���������� �̿��� ��� ū ������ ��κ��� DNA ǥ�����ڰ� ���켺���� �ܼ��� �൨�� ��������� �����Ƿ� ��ü�� ���������� ���� ������ �� �ְ� ���� ��ü�� ���� ���ɿ� ���� ������ ���� �ʴ´�.
DNA ������ �������� �̿� ������μ� ���������� �����ϴ� �������� ���̸� ���� �����Ͽ� �̿��ϴ� ����� �����ϴ� �����ڰ� �Һи��Ͽ� �������� �ϴ� ���������� �����ϰ� ������ DNA �������� �����ϰ� �̸� ���������� �̿��ϴ� ����� ������ �� �ִ�. Ư�� ���� �������̳� ���� ��κ��� ���������� �־�� �� ������ �Ǵ� ������ ���̸� ���� �� �� ����. ���� �� ��쿡�� �������� DNA ���ܹ��� �̿� �Ұ����ϴ�. �׷��� ���������� �����ϴ� �����ڿ� ������ �������� DNA �������� Ȯ���� �� �ִٸ� �̸� �������� DNA ǥ�����ڷ� �̿��� �� �ִ�. �̰��� ����� ��� ���� �����ڿ� �ſ� ������ ��ġ�ϰ� �ִ� DNA ǥ�����ڴ� ���������ڿ� �����ϰ� �����Ǿ� �������� ������ ä �Բ� �Ĵ뿡 ���޵ȴٴ� �����̷п� �����ϰ� �ִ�. DNA ǥ�����ڸ� �̿��� �������� ü��� �� DNA ���� ǥ�������� Ž�� �� ǥ�������� ����
���� �ۼ� �� ǥ�����ڿ� ������������(QTL)�� ������ �м� �� ������ȹ�� QTL�� ���õ� ǥ������ �̿��� 4�ܰ�� ���еǾ� ����ȴ�.

1) DNA ǥ�����ڿ� ������������(QTL)�� �����м�

Ư���� ǥ������(marker loci)���� �븳�������� �и�(segregation)���� ������������ �������� ���ü��� ������ ��� �̵� �������� ���̴� ������ �Ϻΰ� ǥ�� �������� �ٸ��ۿ�(pleiotropy)ȿ���� ���εǾ��ų� (�� ��� ǥ�����ڴ� QTL�� �ǹ���) �Ǵ� ǥ�������� ���������� �Ϻθ� �����ϴ� �ϳ��� ����(�Ǵ� ������ ����)�� �����Ǿ� ������ �ǹ��Ѵ�. ���ڿ����� ���� ������ ǥ�����ڰ� ���������� ���������� ������ ��ĥ �� ǥ�����ڴ� ������ QTL�̹Ƿ� ǥ�������� �������� ���̴� QTL ȿ���� �û��Ѵ�. �׷���, ������ ���ߵ� DNA ���������� ���������� �������� ȿ���� ���� Ȯ���� ����. ������ ��쿡�� ǥ�������� ȿ���� ǥ�������� QTL�� �븳�����ڰ��� ��������� �������� ���ü� ��, ǥ�����ڿ� QTL ������ ���� �ұ���(linkage disequilibrium)�� �����Ѵ�. �����̳� ǰ�� ������ ������ ���� �ұ����� �������ܰ��� ������ ���̿� �¿�ȴ�. Ư�� �̰豳�� ����(outcross population)���� ǥ�����ڿ� QTL�� �����ϰ� �����Ǿ� �ְ� ��ȿ ���� ũ��(effective population size)�� ���� ��� ǥ�����ڿ� QTL�� ������ ������ ���� �ұ����� ����� �� �ִ�. �׷���
ǥ�������� QTL�� �ſ� �����ϰ� �����Ǿ� ���� ���� �� �� �������� ����(crossing over)�������� ��ȯ(recombination)�� �߻��ϸ� ���� �ұ����� ���Ҹ� �ʷ��Ͽ� ���ü��� �־�����. ���� �ұ���(D)�� n���뵿�� ��ȯ(r)�� ���� D(1-r)n���� ��ȭ�ȴ�(Falconer, 1989). ���� ǥ�����ڰ� QTL�� ����� ���� ���� �ұ����� ������ ���� �����Ǿ� ���߿� ȿ�������� �̿��� �� �ִ�. ǥ�����ڿ� QTL ������ 5-20 cM ���ؿ��� ������ �� ��μ� ǥ�����ڰ� ���������� �̿� ������ ������ �˷��� �ִ�(Smith�� Smith, 1993). ǥ�����ڿ� QTL���� ������ ���� �м��� ���� ��찡 ������ ����� �ٸ� ����(ǰ�� �Ǵ� �ٱ�����)���� ���迡 ���� F1 ���볢�� ���踦 ���Ͽ� ������ F2 ���뿡�� ��������� ǥ���� �ɷ°� ǥ�� ������������ �񱳿� �����Ѵ�. �� �ٸ� ������δ� Ư�� �и�����(segregation population)���� ǥ�� ������������ ���賻(within-family)�񱳸� ���Ͽ� �������踦 �м��Ѵ�. ������ ����� �ٸ� �� ���ܰ��� ���迡 ���� ����� Ư�� ������ ���� ���׼��̳� ������������ ���̴� ���̿� ���� ���ܰ��� ������ ���� ���� ���̰� ū ��� ���� ȿ������ QTL ������ �� �� �ְ� �ݴ�� �� ������ ���賻 �񱳿� ������ ����� ������ ���� ���ܳ� �����л��� ���� ū ���� � ������ ��ġ�� QTL�� ȿ�������� ������ �� �ִ�(Soller ��, 1990). �׷���, ���ڿ� ���� ����� ����ó�� ���赿���̳� �Ĺ����� ���� �̿�Ǹ� ���������� �ٱ��� �̿��� �ſ� ������ �ʴ�. �Ϻ� ���迡���� �ش��� ǥ������ ���� ���밣�� ���谡 ��� �̿�DZ⵵ �Ѵ�. ���� �幰�� ���� ���� F1�� F2 ��ü�� ������ �߰� ���� ���࿡�� �����ϳ� �뵿���� ���� ���� ���밣���� ��� ������ ������ ������ �̿뿡 ������� ����. �׷��� �̰豳�� ���ܿ��� ǥ�����ڿ� ������ QTL���� ���� �ұ����� ���賻���� ������ �� �ִ�. �̴� ǥ�����ڿ� QTL�� ���и�(co-segregation)���� �����Ѵ�. ������ ���ҿ��� ǥ�����ڿ� QTL���� �����м��� ���ο� ���輳�� �������μ� �Ĵ������ ���� �������(daughter design) �Ǵ� �ճ೶�� ����(granddaughter design; GDD)�� �̿��Ͽ� �ΰ� ������(paternal half-sib) ���賻���� ������ �� �ִ�. �̰豳�� ���ܿ��� QTL ������ ���� ���м� ������δ� �л�м�(variance analysis), ȸ�ͺм�(regression analysis), ������������������
(best linear unbiased prediction; BLUP), ȥ�ո���(mixture models) �� ȥ������ ����(mixed inheritance models) ���� �̿�ǰ� �ִ�. ���м� �������� �ֿ� ���������� ó�� 3���� ����� ǥ�� ������������ ��� ǥ���� ���̿� ���� �������� �̿��ϴ� �ݸ鿡 ������ 2���� ����� ǥ�� ���������� ���� ������ ���� ������ ���� �̿��Ѵ�. ǥ�����ڿ� QTL �����м��� �����ϱ� ���ؼ��� ���鰳�� ǥ�����ڿ� ����� �౺���κ��� ǥ���� ������ �䱸�ȴ�. �ΰ��� ������ ������ ���ؼ� ������ ��ü ������ �������̴� �� 30 Morgan(M)���� �����ȴ�. 1M ������ �����(���ļ���) ������ ���� �󵿿���ü���� ��������� 1ȸ�� ������ �߻��ϴ� �Ÿ��� ���Ѵ�. ������ ǥ�����ڵ鰣�� 20cM�� ������ �����Ÿ��� �ۼ��� �� �����ϰ� ������ ������ ������ ��� ���ؼ��� �� 150���� ǥ�����ڰ� �䱸�ȴ�. �׸��� ������ ������ ������ ������ ���� ����(genetic linkage map)�� �ۼ��ϱ� ���ؼ��� �Ƹ��� �̺��� �ξ� �� ���� ǥ�����ڰ� �ʿ��� ���̴�. ��� Ư���� QTL�� ��� 10cM (0-20cM)�̳��� ��ġ�ϴ� ǥ�����ڸ� ��� ���ؼ��� �� 200-250���� ǥ�����ڰ� �䱸�ȴٰ� �Ѵ�(Backmann �� Soller, 1983). ���� DNA ǥ�����ڸ� �̿��Ͽ� QTL�� �����ϱ� ���ؼ��� ���� ������� �̿��� �� ������ �ַ� �ĺ� �����ڸ� �̿��Ͽ� �����ϴ� ���(candidate gene approach; CGA)�� ������ ǥ�����ڸ� ���� �Գ� ��ü�� �˻��ϴ� ���ٹ��(total genome approach; TGA)�� �̿��Ͽ� Ȯ���� �� �ִ�. �ĺ������� �̿� ���ٹ��(CGA)�� ������ �� �������� ����� �� �˷��� �ִ� �����ڵ��� �ĺ������ڷ� �̿��ϴ� ����̴�. CGA ����� ��ü �Գ� ���ٹ���� ���Ͽ� ���� �ս��� �������� �ڷḦ �м��ϰ� ���� �� �־� QTL�� ���õ� �����ڳ� ���������� ���� �����ڸ� Ž���ϴµ� �θ� �̿�ǰ� �ִ�. ��, ���ڼ��� ���� ���������� ������ ��ġ�� QTL�� ã�� ���ؼ��� ���İ����� �߿��� ������ �ϴ� ESR(estrogen receptor)�����ڸ� �̿��ϰų� ���� �� ���� Ư���� ������ ��ġ�� QTL�� �˻��ϱ� ���ؼ��� ���� �ܹ����� ������ Myo D ������ �׸��� �׺����� ���õ� QTL�� �����ϱ� ���ؼ��� �鿪���� ��������� ����ϴ� MHC �����ڸ� �ĺ������ڷ� �����Ͽ� �̿��Ѵ�. �׸��� ��ü �Գ� ���ٹ��(TGA)�� ���������� �����ϴ� �����ڵ��� ��ġ�ϰ� �ִ� ����ü ������ �־� �˷����� ���� ������ ���� ������ ǥ�����ڸ� �̿��Ͽ� �˻��Ѵ�. �̷��� ����� �̿��Ͽ� �������� �󿰻�ü�� ��ġ�ϰ� �ִ� 105���� DNA ǥ�����ڸ� �̿��Ͽ� ����� �� ���������� ������ ��ġ�� QTL�� �� 4�� ����ü���� �Ϻο� �����ϰ� �ִٴ� ����� �����´�(Andersson ��, 1994). ���� 159���� microsatellite ǥ�����ڸ� �̿��Ͽ� ������ ������ �����ϴ� QTL (LOD score �� 3.0)�� �� 1, 6, 9, 10 �� 20���� ����ü�� �����Ѵٴ� ���� �˷��� �ִ�(Georges ��, 1995).

2) ǥ�����ڸ� �̿��� ������(Marker Assisted Breeding)

(1) ǥ������ �̿� ���߹�(MAS)

���� ���������� �־� ������ ����� �Ǵ� �κ��� ���������� �����ϴ� �������� ��, ������������(quantitative trait loci; QTL)�̴�. �������������� ���� ������ ���Ͽ� ū ������ ��ġ�� ������ �����ڵ��̴�. �׸��� QTL�� Ư�� ���������� ��ġ�� ���� �� �̸� ������������(economic trait loci; ETL)��� �θ��⵵ �Ѵ�. ���� RFLP, minisatellite, microsatellite, RAPD �� SSCP ��� ���� DNA �����м��� ���Ͽ� QTL�� �����ϰ� ������ DNA ǥ�����ڰ� Ȯ�εǸ� DNA ǥ�����ڸ� ������ǥ�� �ϴ� ���ο� ������������ �����ϰ� �ǰ� �̿Ͱ��� ������������(QTL) �Ǵ� ������������(ETL)�� ���õ� DNA ǥ�����ڸ� �̿��Ͽ� ������ �����ϴ� ����� ǥ�������� �̿� ���߹�(marker-assisted selection;MAS) �Ǵ� �������� �̿� ���߹�(genotype-assisted selection; GAS)�̶�� �Ѵ�. ��ó�� DNA �����м� ����� ������ ���� ���� DNA ǥ�����ڿ� �ֿ� ������������� ���ü��� �����Ͽ� QTL�� ������ DNA ǥ�����ڸ� �����ϰ� �̸� ��ǥ���Ͽ� �������� �ϴ� �����ڸ� �����ϰ� �ִ� ��ü�� ���� �����ϴ� MAS�� ���ο� ���� ����� ������ ������ ǥ�������� ������ �������� ���� �������κ��� �������� �� ��ü�� ���� ���� ������ �����ϰ� �����ν� ������ ���������� �ϴ� ������ �������� ��Ⱑ �Ǿ���. �Ϲ������� ���߿� ���� ���Ǵ� ���������� �Ⱓ ������ ������(genetic gain)�� ���߰���, ������ ��Ȯ��, ���� �����л� �� ���밣�ݿ� ���Ͽ� �����Ǵµ� ǥ�����ڸ� ���Ͽ� ���� QTL������ ���������� �Ǵ� ��κ��� ��� �̵� ���ο� ������ ��ģ��. Ư��, ���ߴ�� ������ �������� ���� ǥ�����ڰ� �����ϴ� ���� �����л��� ������ Ŭ �� MAS�� ȿ���� ��������� ũ��. Lande�� Thompson(1990)�� ���ϸ� Ư�� ���������� �������� 0.2�̰� ǥ�����ڰ� 20%�� ���� �����л��� ��Ÿ�� �� �������� ���������� ���Ͽ� �� 50%�� �߰����� ������ �������� ���� �� �ִٰ� �Ѵ�. MAS�� �������� ����� �������� ���߹���� ���Ͽ� ������ ���� ������ ������ �ִ�. ù°, ������ ��Ȯ���� ������ų �� �ִ�. ǥ���� ��ϰ� �Բ� �߰������� DNA ǥ�����ڿ� ���� ������ �����Ͽ� �־��� ��� ��ü�� ������(breeding value) ����ġ�� ���� ��Ȯ���� ����ų �� �־� Ư��, �������� ���ų� ���� ���� ������ ������ ���� ��ü���߿� �ſ� ȿ�����̰� ����ִ� ���࿡�� ��Ȯ�� ������ �� ���� ��ü����(carcass traits)�� ���� ��� ��ü���߿� �����ϴ�. ��°, ���밣���� �����ų �� �ִ�. DNA ǥ�����ڿ� ���� ������ ��ü�� ������, ��� ��� �Ǵ� ��ñ� �� ����ܰ質 ���ɿ� ������� ������ �̿��� �� �־� ���������̳� ���������� ������ ���Ŀ� �����Ǵ� ������ ���� ���⼱���� �����Ͽ� ���밣���� ȹ�������� ���ҽ�ų �� �ִ�. ���� DNA ǥ�����ڿ� ���� ���� �˻��� �ɷ°����̳� �Ĵ������ �̿�Ǵ� �������� ���� ���ҽ��� ���� ����� ũ�� ���� �� �ִ�. ��°, ���߰����� ������ų �� �ִ�. DNA ǥ�����ڿ� ���� ������ ��ü�� ���� �Ӹ� �ƴ϶� ���� ������� �̷���� �� �־� ���ڼ��� ���� ���࿡�� �����Ǵ� ������ ���Ͽ� ���߰����� ����ų �� �ְ� ���ÿ� �������� �����ɷ� �򰡵� �����ϴ�. �̿Ͱ��� DNA ���� ������ ǥ�������ڸ� �̿��ϴ� MAS�� �������� ����� ���߽ñ� �� ��Ȯ���� ū ������ ��ġ�Ƿν� ȿ������ ������ �����ϸ� ������ �����ӵ��� ����ȭ ��ų �� �ִ�.
Favorite Links
.

FortuneCity
Here is a link to FortuneCity.



This page has been visited times.